🔷با توجه به اهمیت تحصیلات تکمیلی در ارتقا کمی و کیفی موسسات آموزش عالی و در راستای اهداف و ماموریت دانشگاه که همانا تولید علم، فناوری و تربیت نیروهای متخصص در عرصه های گوناگون علمی است، دانشگاه شهرکرد فعالیت های آموزشی خود را در سطح تکمیلی با پذیرش تعداد 5 دانشجو در سال تحصیلی 1379 در مقطع کارشناسی ارشد ناپیوسته مهندسی کشاورزی با گرایش اصلاح نباتات آغاز نمود.

🔷در طول 16 سال گذشته تحصیلات تکمیلی در دانشگاه شهرکرد رشد چشمگیری داشته بطوریکه هم اکنون این دانشگاه در ۱30 رشته و گرایش دانشجوی تحصیلات تکمیلی پذیرش می کند. این دانشگاه در سال جاری در 82 رشته و گرایش در مقطع کارشناسی ارشد به صورت روزانه و نوبت دوم دانشجو پذیرش کرده است. همچنین در مقطع دکترای تخصصی نیز در این دانشگاه در 48 رشته و گرایش پذیرش دانشجو صورت می گیرد. علاوه بر این پردیس دانشگاه در ۱۵ رشته دکترای تخصصی و ۱۲ رشته کارشناسی ارشد دانشجو می پذیرد.

 🔷کلیه امور تحصیلی دانشجویان تحصیلات تکمیلی پذیرفته شده بصورت روزانه،‌‌‌ نوبت دوم، استعدادهای درخشان و پردیس خود گردان به عهده تحصیلات تکمیلی دانشگاه می باشد.  

🔷 مدیران تحصیلات تکمیلی از ابتدا تا کنون به شرح ذیل بوده اند: 

آقای دکتر جهانگرد محمدی از 19/ 12/ 80 تا 12/ 7/ 82

آقای دکتر اسماعیل اسدی از 12/ 7/ 82 تا 24/ 2/ 83

آقای دکتر نادر ساکنیان از 24/ 3/ 83 تا 23/ 8/ 84

آقای دکتر شهرام محمدی از 23/ 8/ 84 تا 3/ 7/ 86

آقای دکتر ناصر شمس اسفند آبادی از23/ 7/ 86 تا 5/ 12/ 1391

آقای دکتر محسن مبینی دهکردی از 5/ 12/ 1391 تا ۷/ ۳/ ۱۳۹۳

آقای دکتر سعید حبیبیان دهکردی از تاریخ ۷/ ۳/ 13۹۳ تا 1395/9/30

​آقای دکتر عبدالرحمان محمدخانی از تاریخ 1395/10/6 تا کنون

🔷 اعضای شورای تحصیلات تکمیلی در حال حاضر به شرح ذیل می باشد:

✅ دکترحمداله مشتاقی معاون آموزشی دانشگاه

✅ دکترمحسن مبینی معاون پژوهشی دانشگاه

✅ دکتر عبدالرحمان محمدخانی مدیر تحصیلات تکمیلی دانشگاه

✅ دکتر سجاد رستمی مدیر امور آموزشی دانشگاه

✅ دکتر امین صادق بیغم معاون پژوهشی و تحصیلات تکمیلی دانشکده دامپزشکی

✅ دکتر احمدرضا قاسمی معاون پژوهشی و تحصیلات تکمیلی دانشکده کشاورزی

✅ دکتر افشین احمدی ندوشن معاون تحصیلات تکمیلی دانشکده فنی و مهندسی

✅ دکتر خدایار عبداللهی معاون پژوهشی و تحصیلات تکمیلی دانشکده منابع طبیعی و علوم زمین

✅ دکتر محمد غلامی مدیر پژوهشی و تحصیلات تکمیلی دانشکده علوم ریاضی

✅ دکتر ابراهیم بنی طالبی معاون پژوهشی و تحصیلات تکمیلی دانشکده ادبیات و علوم انسانی

✅ دکتر حمید مصدق معاون پژوهشی و تحصیلات تکمیلی دانشکده علوم پایه

✅ دکتر محمداحسان بصیریرئیس اداره آموزش­های آزاد و مجازی